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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
21/01/2019 |
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Data da última atualização: |
12/02/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ALVES-FREITAS, D. M. T.; PINHEIRO-LIMA, B.; FARIA, J. C.; LACORTE, C.; RIBEIRO, S. G.; MELO, F. L. |
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Afiliação: |
DIONE M. T. ALVES-FREITAS; BRUNA PINHEIRO-LIMA; JOSIAS CORREA DE FARIA, CNPAF; CRISTIANO CASTRO LACORTE, Cenargen; SIMONE DA GRACA RIBEIRO, Cenargen; FERNANDO L. MELO, UNB. |
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Título: |
Double-stranded RNA high-throughput sequencing reveals a new Cytorhabdovirus in a bean golden mosaic virus-resistant common bean transgenic line. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Viruses, v. 11, n. 1, Jan. 2019. |
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ISSN: |
1999-4915 |
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DOI: |
10.3390/v11010090 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Using double-strand RNA (dsRNA) high-throughput sequencing, we identified five RNA viruses in a bean golden mosaic virus (BGMV)-resistant common bean transgenic line with symptoms of viral infection. Four of the identified viruses had already been described as infecting common bean (cowpea mild mottle virus, bean rugose mosaic virus, Phaseolus vulgaris alphaendornavirus 1, and Phaseolus vulgaris alphaendornavirus 2) and one is a putative new plant rhabdovirus (genus Cytorhabdovirus), tentatively named bean-associated cytorhabdovirus (BaCV). The BaCV genome presented all five open reading frames (ORFs) found in most rhabdoviruses: nucleoprotein (N) (ORF1) (451 amino acids, aa), phosphoprotein (P) (ORF2) (445 aa), matrix (M) (ORF4) (287 aa), glycoprotein (G) (ORF5) (520 aa), and an RNA-dependent RNA polymerase (L) (ORF6) (114 aa), as well as a putative movement protein (P3) (ORF3) (189 aa) and the hypothetical small protein P4. The predicted BaCV proteins were compared to homologous proteins from the closest cytorhabdoviruses, and a low level of sequence identity (15?39%) was observed. The phylogenetic analysis shows that BaCV clustered with yerba mate chlorosis-associated virus (YmCaV) and rice stripe mosaic virus (RSMV). Overall, our results provide strong evidence that BaCV is indeed a new virus species in the genus Cytorhabdovirus (family Rhabdoviridae), the first rhabdovirus to be identified infecting common bean. |
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Palavras-Chave: |
Rhabdovirus. |
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Thesagro: |
Feijão; Mosaico Dourado; Organismo Transgênico; Phaseolus Vulgaris; Vírus. |
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Thesaurus Nal: |
Bean golden mosaic virus; Beans; Cytorhabdovirus; DsRNA viruses; Transgenic plants. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/191029/1/CNPAF-2019-viruses.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
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Registro |
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Status |
URL |
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| Registros recuperados : 33 | |
| 2. |  | ALVES-FREITAS, D. M. T.; MELO, F. L.; FARIA, J. C.; RIBEIRO, S. G. DSRNA deep sequencing reveals five viral species in common beans. Virus Reviews & Research, Brasília, DF, v. 20, n. 2, p. 43-44, Aug./Dec. 2016. Edição dos Resumos do XXVII Brazilian Congress of Virology, XI Mercosur Meeting of Virology, Pirenópolis, GO, Sept. 2016. Ref. PIV99.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 3. | | ALVES-FREITAS, D. M. T.; MELO, F. L.; FARIA, J. C.; RIBEIRO, S. G. DSRNA deep sequencing reveals five viral species in common beans. Virus Reviews & Research, Brasília, DF, v. 20, n. 2, p. 43-44, Aug./Dec. 2016. Ref. PIV99. Edição dos Resumos do XXVII Brazilian Congress of Virology, XI Mercosur Meeting of Virology, Pirenópolis, GO, Sept. 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 6. | | LIMA, B. P.; ALVES-FREITAS, D. M. T.; GODINHO, M. T.; FARIA, J. C.; LACORTE, C.; RIBEIRO, S. G. High incidence of mixed DNA and RNA virus infections in common bean in Central Brazil. Virus Reviews & Research, Brasília, DF, v. 20, n. 2, p. 132-133, Aug./Dec. 2016. Edição dos Resumos do XXVII Brazilian Congress of Virology, XI Mercosur Meeting of Virology, Pirenópolis, GO, Sept. 2016. PIV151.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 7. | | LIMA, B. P.; ALVES-FREITAS, D. M. T.; GODINHO, M. T.; FARIA, J. C.; LACORTE, C.; RIBEIRO, S. G. High incidence of mixed DNA and RNA virus infections in common bean in Central Brazil. Virus Reviews & Research, Brasília, DF, v. 20, n. 2, p. 132-133, Aug./Dec. 2016. Ref. PIV151. Edição dos Resumos do XXVII Brazilian Congress of Virology, XI Mercosur Meeting of Virology, Pirenópolis, GO, Sept. 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 8. | | LIMA, B. P. de; ALVES-FREITAS, D. M. T.; MELO, F. L. de; CARVALHO, R. de C. P.; FARIA, J. C. de; RIBEIRO, S. G. Characterization of a new whitefly-transmitted (Bemisia tabaci Meam 1) cytorhabdovirus infecting common bean. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 12., 2017, Piracicaba. Produtividade e sustentabilidade da cultura do feijão: do campo para a mesa: resumos. Piracicaba: CENA: IAC, 2017. p. 52. CONAFE| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 9. | | LIMA, B. P. de; ALVES-FREITAS, D. M. T.; MELO, F. L. de; CARVALHO, R. de C. P.; FARIA, J. C. de; RIBEIRO, S. G. Characterization of a new whitefly-transmitted (Bemisia tabaci Meam 1) cytorhabdovirus infecting common bean. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 12., 2017, Piracicaba. Produtividade e sustentabilidade da cultura do feijão: do campo para a mesa: resumos. Piracicaba: CENA: IAC, 2017. p. 52. CONAFE| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 10. | | LUSTOSA, F. L. F.; GOUVEA, E. G.; SANTOS, S. P.; MARQUES, T.; ALVES FREITAS, D. M. T.; BERTIOLI, D. J.; MORETZSOHN, M. de C. Comparative mapping of the AA genome of Arachis with the model legumes Lotus japonicus and Medicago truncatula. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia, SP. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2009. p. 165.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 11. | | PINHEIRO-LIMA, B.; VIDAL, A. H.; ALVES-FREITAS, D. M. T.; SANCHES, M. M.; FARIA, J. C. de; LACORTE, C. C.; MELO, F. L.; RIBEIRO, S. da G. Occurrence of bean-associated cytorhabdovirus in soybean fields in Brazil. Crop Protection, v. 163, 2023. 106103 Na Publicação: Josias Correa Faria; Cristiano Lacorte; Simone Graça Ribeiro.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Gado de Corte; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 12. | | LAMAS, N. S.; MATOS, V. O. R. L.; ALVES-FREITAS, D. M. T.; MELO, F. L.; COSTA, A. F.; FARIA, J. C. de; RIBEIRO, S. G. Occurrence of cowpea mild mottle virus in common bean and associated weeds in Northeastern Brazil. Plant Disease, St. Paul, v. 101, n. 10, p. 1828, 2017. Disease notes.| Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 13. | | ALVES-FREITAS, D. M. T.; RIBEIRO, G. C.; MATOS, V. O. R. L.; MELO, L. C.; FARIA, J. C.; RIBEIRO, S. G. Detection of two endornavirus in common bean genotypes in Brazil. Virus Reviews & Research, Brasília, DF, v. 20, p. 215, Oct. 2015. Supplement 1, ref. PIV437. Edição dos Resumos do XXVI Brazilian Congress of Virology, X Mercosur Meeting of Virology, Florianóplis, SC, Oct. 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 14. | | FONTENELE, R. S.; ALVES-FREITAS, D. M. T.; SILVA, P. I. T.; FORESTI, J.; SILVA, P. R.; GODINHO, M. T.; VARSANI, A.; RIBEIRO, S. G. Discovery of the first maize-infecting mastrevirus in the Americas using a vector-enabled metagenomics approach. Archives of Virology, v. 163, n. 1, p. 263-267, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 15. | | RIBEIRO, W. R.; ALVES-FREITAS, D. M. T.; MATOS, L. R. de; NEIVA, E. N.; FERREIRA, A. L.; FARIA, J. C. de; SOUZA, T. L. P. O. de; RIBEIRO, S. da G.; PINHEIRO, P. V. Cowpea Mild Mottle Virus é transmitido de modo semipersistente para o feijoeiro-comum. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 14., 2020, Santo Antônio de Goiás. Resumos... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2021. p. 41.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 16. | | RIBEIRO, W. R.; ALVES-FREITAS, D. M. T.; MATOS, L. R. de; NEIVA, E. N.; FERREIRA, A. L.; FARIA, J. C. de; SOUZA, T. L. P. O. de; RIBEIRO, S. da G.; PINHEIRO, P. V. Cowpea Mild Mottle Virus é transmitido de modo semipersistente para o feijoeiro-comum. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 14., 2020, Santo Antônio de Goiás. Resumos... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2021. p. 41.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 17. | | BATISTA, J. G.; MELO, F. F. S.; NERY, F. M. B.; MELO, F. L.; BOITEUX, L. S.; FONSECA, M. de E. N.; LACORTE, C. C.; ALVES-FREITAS, D. M. T.; RIBEIRO, S. da G.; PEREIRA-CARVALHO, R. de C. Characterization of genetically divergent tomato-associated geminivirus 1 isolates from table beet (Beta vulgaris) and tomato (Solanum lycopersicum). Tropical Plant Pathology, v. 46, p. 62-68, 2021. Na publicação: Cristiano Lacorte; Simone Graça Ribeiro.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 18. | | VIDAL, A. H.; SANCHES, M. M.; ALVES-FREITAS, D. M. T.; ABREU, E. F. M.; LACORTE, C. C.; PINHEIRO-LIMA, B.; ROSA, R. C. C.; JESUS, O. N. de; CAMPOS, M. A.; VARSANI, A.; RIBEIRO, S. da G. First world report of Cucurbit Aphid-Borne yellows virus infecting passionfruit. Plant Disease, v. 102, n. 12, p. 2665, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 19. | | VIDAL, A. H.; SANCHES, M. M.; ALVES-FREITAS, D. M. T.; ABREU, E. F. M.; LACORTE, C. C.; PINHEIRO-LIMA, B.; ROSA, R. C. C.; JESUS, O. N. de; CAMPOS, M. A.; VARSANI, A.; RIBEIRO, S. da G. First world report of Cucurbit Aphid-Borne yellows virus infecting passionfruit. Plant Disease v. 102, n. 12, p. 2665, 2018. Na publicação: C. Lacorte, O. N. Jesus, S. G. Ribeiro.| Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 20. | | FONTENELE, R. S.; ABREU, R. A.; LAMAS, N. S.; ALVES-FREITAS, D. M. T.; VIDAL, A. H.; POPPIEL, R. R.; MELO, F. L.; LACORTE, C.; MARTIN, D. P.; CAMPOS, M. A.; VARSANI, A. V.; RIBEIRO, S. G. Passion fruit chlorotic mottle virus: molecular characterization of a new divergent geminivirus in Brazil. Viruses, v. 10, n. 4, 2018. Article 169.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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